根據最新信息《Plos Computational Biology》期刊在JCR分區中的排名如下：
學科分類：BIOCHEMICAL RESEARCH METHODS(生化研究方法)
| 按JIF指標學科分區 | 收錄子集 | 分區 | 排名 | 百分位 |
| 學科：BIOCHEMICAL RESEARCH METHODS | SCIE | Q1 | 15 / 85 |
82.9% |
| 學科：MATHEMATICAL & COMPUTATIONAL BIOLOGY | SCIE | Q1 | 11 / 65 |
83.8% |
| 按JCI指標學科分區 | 收錄子集 | 分區 | 排名 | 百分位 |
| 學科：BIOCHEMICAL RESEARCH METHODS | SCIE | Q1 | 15 / 85 |
82.94% |
| 學科：MATHEMATICAL & COMPUTATIONAL BIOLOGY | SCIE | Q1 | 12 / 65 |
82.31% |
這表明該刊在生化研究方法領域具有較高的學術影響力和認可度。此外，該刊創刊時間：2005年，影響因子：3.8，出版周期：Monthly、出版商：Public Library of Science以及收錄情況等信息也為其學術影響力提供了有力支持。
影響因子：是湯森路透(Thomson Reuters)出品的期刊引證報告(Journal Citation Reports,JCR)中的一項數據，現已成為國際上通用的期刊評價指標，不僅是一種測度期刊有用性和顯示度的指標，而且也是測度期刊的學術水平，乃至論文質量的重要指標。
